ҚЫЛШЫҚ ЖҮНДІ ҚҰЙРЫҚТЫ САРЫАРҚА ҚОЙ ТҰҚЫМЫНДА (ЖАҢААРҚА ТИПІ) ӨНІМДІЛІГІМЕН БАЙЛАНЫСТЫ КАНДИДАТ ГЕНДЕРДІ ТАЛДАУ

Айнұр Орақбаева; Қайрат Досыбаев; Шолпан Адылканова; Алтынай  Қожахмет; Марина Ермекова; Тілек Қапасұлы; Мақпал Амандықова

doi:10.37884/3-2025/06

Аннотация

Порода овец Сарыарка - относятся к числу казахстанских курдючных грубошерстных пород, отличающихся высокой мясной продуктивностью и плодовитостью. Живая масса животных и морфометрические показатели представляют собой важные фенотипические признаки, используемые в селекционной работе, особенно при совершенствовании мясной продуктивности.В данном исследовании проведено выявление ассоциаций между геномными SNP-маркерами и показателями живой массы, а также восмью основными промерами тела (высота в холке, высота в крестце, ширина груди, глубина груди, косая длина туловища, ширина в маклоках, обхват груди и обхват голени) у курдючных овец породы Сарыарка. Для анализа было отобрано 60 проб крови, из которых выделена геномная ДНК, после чего выполнено генотипирование с использованием чипа OvineSNP50 Genotyping BeadChip. Полученные SNP-маркеры были аннотированы и сопоставлены с геномом Ovis aries (Oar_v3.1) через платформу BioMart. В результате установлено, что с живой массой и четырьмя морфологическими признаками ассоциированы шесть кандидатных генов: IGFBP6, ST7, SCD5, DTNBP1, KYNU и FTO. Таким образом, полученные данные позволили выявить молекулярные маркеры, связанные с мясной продуктивностью у овец породы Сарыарка, что формирует научную основу для развития маркер-ассоциированной селекции. Это открывает перспективы для целенаправленного и более эффективного генетического отбора в овцеводстве.

Результаты исследования позволили идентифицировать молекулярные маркеры, связанные с мясной продуктивностью у овец породы сарыарка, что формирует научную основу для развития маркерной селекции.

курдючная грубошерстная порода Сарыарка SNP мясная продуктивность GWAS кандидатные гены

01 Введение

Полный текст статьи доступен для скачивания в формате PDF на панели справа.

02 Список литературы

1. Адылканова Ш. Р., Садыкулов Т. С., Орақбаева А. Д., Сансызбаева Б. Қ. Формирование мясной продуктивности ягнят сарыаркинской курдючной породы овец (внутрипородный жанааркинский тип) // Ізденістер, нәтижелер– 2023. – № 4 (100). – С. 20–27. – DOI: https://doi.org/10.37884/4-2023/03
2. Visscher P.M., Wray N.R., Zhang Q., Sklar P., McCarthy M.I., Brown M.A., Yang J. 10 years of GWAS discovery: biology, function, and translation // Nature Reviews Genetics. – 2017. – Vol. 18, No. 2. – P. 117–127.
3. Kirichenko A.V., Zlobin A.S., Shashkova T.I., Volkova N.A., Iolchiev B.S., Bagirov V.A., Borodin P.M., Karssen L.S., Tsepilov Y.A., Aulchenko Y.S. The GWAS-MAP|ovis platform for aggregation and analysis of genome-wide association study results in sheep. – 2022. – Preprint.
4. Kirichenko A.V., Zlobin A.S., Shashkova T.I., Volkova N.A., Iolchiev B.S., Bagirov V.A., Borodin P.M., Karssen L.S., Tsepilov Y.A., Aulchenko Y.S. The GWAS-MAP|ovis platform for aggregation and analysis of genome-wide association study results in sheep. – 2022. – Preprint.
5. Bolormaa S., et al. A genome-wide association study of meat and carcass traits in sheep // Genetics Selection Evolution. – 2016. – Vol. 48. – P. 38.
6. Zhang L., Liu J., Zhao F., Ren H., Xu L., Lu J., Zhang S., Zhang X., Wei C., Lu G., Zheng Y., Du L. Genome-wide association studies for growth and meat production traits in sheep // PLOS ONE. – 2013. – Vol. 8(6). – e66569.
7. Riggio V., Pong-Wong R., Sallé G., et al. A genome-wide association study for wool, skin, and body weight traits in sheep // PLOS ONE. – 2013. – Vol. 8(12). – e81956.
8. Садыкулов Т. С., Адылканова Ш. Р. Селекционно-генетические аспекты совершенствования курдючных пород овец: монография. – Алматы: Альманах, 2022. – 180 с.
9. Jiang J., Cao Y., Shan H., Wu J., Song X., Jiang Y. The GWAS analysis of body size and population verification of related SNPs in Hu sheep // Animals. – 2022. – Vol. 12(20). -P. 2792. https://doi.org/10.3390/ani12202792
10. Abdoli R., Mirhoseini S.Z., Ghavi Hossein-Zadeh N., Zamani P., Ferdosi M.H., Gondro C. Genome-wide association study of four composite reproductive traits in Iranian fat-tailed sheep // Reproduction, Fertility and Development. – 2019. – Vol. 31(8). – P. 1305–1314. https://doi.org/10.1071/RD18282
11. Al-Mamun H.A., Kwan P., Clark S.A., Ferdosi M.H., Tellam R., Gondro C. Genome-wide association study of body weight in Australian Merino sheep reveals an orthologous region on OAR6 to human and bovine genomic regions affecting height and weight // Genetics Selection Evolution. – 2015. – Vol. 47. – P. 66.
12. Ghasemi M., Hossein-Zadeh N.G., Zamani P. Identification of candidate genes and pathways affecting meat quality traits in sheep using GWAS and bioinformatics analysis // Animal Genetics. – 2020. – Vol. 51. – P. 678–689
13. Kijas J.W., Lenstra J.A., Hayes B., Boitard S., et al. Genome-wide analysis of the world's sheep breeds reveals high levels of historic mixture and strong recent selection // PLOS Biology. – 2012. – Vol. 10(2). – e1001258.
14. Andersson L., Archibald A.L., Bottema C.D., et al. Coordinated international action to accelerate genome-to-phenome with FAANG, the Functional Annotation of Animal Genomes project // Genome Biology. – 2015. – Vol. 16. – P. 57.
15. Meuwissen, T. H. E., Hayes, B. J., & Goddard, M. E. (2013). Accelerating improvement of livestock with genomic selection. Annual Review of Animal Biosciences, 1, 221–237.
16. Садықұлов Т.С., Ким Г.Л., Жазылбеков Қ.З., Имашев С.Д., Бұралқиев Б.А. Ауыл шаруашылық жануарларын өсіру және селекциялау: оқу құралы. – Павлодар: Кереку, 2003. – 29–34-бб.
17. PLINK1.9Home. Available online: https://www.cog-genomics.org/plink/ (accessed on 14 April 2025)
18. Ensembl. Available online: http://www.ensembl.org/biomart/martview/ (accessed on 14 April 2025).
19. The R Project for Statistical Computing. Available online: https://www.r-project.org/ (accessed on 14 April 2024)

Ссылки для цитирования

[1]2025. АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП). Izdenister natigeler. 3 (107) (Sep. 2025), 55–64. DOI:https://doi.org/10.37884/3-2025/06.

(1)АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП). Izdenister natigeler 2025, No. 3 (107), 55-64. https://doi.org/10.37884/3-2025/06.

АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП). (2025). Izdenister Natigeler, 3 (107), 55-64. https://doi.org/10.37884/3-2025/06

АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП). Izdenister natigeler, [S. l.], n. 3 (107), p. 55–64, 2025. DOI: 10.37884/3-2025/06. Disponível em: https://natsus.kaznaru.edu.kz/index.php/research/article/view/1060. Acesso em: 15 sep. 2026.

“АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП)”. 2025. Izdenister Natigeler, no. 3 (107) (September): 55-64. https://doi.org/10.37884/3-2025/06.

“АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП)” (2025) Izdenister natigeler, (3 (107), pp. 55–64. doi:10.37884/3-2025/06.

[1]“АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП)”, Izdenister natigeler, no. 3 (107), pp. 55–64, Sep. 2025, doi: 10.37884/3-2025/06.

“АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП)”. Izdenister Natigeler, no. 3 (107), Sept. 2025, pp. 55-64, https://doi.org/10.37884/3-2025/06.

“АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП)”. Izdenister natigeler, no. 3 (107) (September 30, 2025): 55–64. Accessed September 15, 2026. https://natsus.kaznaru.edu.kz/index.php/research/article/view/1060.

1.АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП). Izdenister natigeler [Internet]. 2025 Sep. 30 [cited 2026 Sep. 15];(3 (107):55-64. Available from: https://natsus.kaznaru.edu.kz/index.php/research/article/view/1060

1.АНАЛИЗ КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У САРЫАРКИНСКОЙ КУРДЮЧНОЙ ГРУБОШЕРСТНОЙ ПОРОДЫ ОВЕЦ (ЖАНААРКИНСКИЙ ТИП). Izdenister natigeler. 2025;(3 (107):55-64. doi:10.37884/3-2025/06

[1] 1. Адылканова Ш. Р., Садыкулов Т. С., Орақбаева А. Д., Сансызбаева Б. Қ. Формирование мясной продуктивности ягнят сарыаркинской курдючной породы овец (внутрипородный жанааркинский тип) // Ізденістер, нәтижелер– 2023. – № 4 (100). – С. 20–27. – DOI: https://doi.org/10.37884/4-2023/03

[2] 2. Visscher P.M., Wray N.R., Zhang Q., Sklar P., McCarthy M.I., Brown M.A., Yang J. 10 years of GWAS discovery: biology, function, and translation // Nature Reviews Genetics. – 2017. – Vol. 18, No. 2. – P. 117–127.

[3] 3. Kirichenko A.V., Zlobin A.S., Shashkova T.I., Volkova N.A., Iolchiev B.S., Bagirov V.A., Borodin P.M., Karssen L.S., Tsepilov Y.A., Aulchenko Y.S. The GWAS-MAP|ovis platform for aggregation and analysis of genome-wide association study results in sheep. – 2022. – Preprint.

[4] 4. Kirichenko A.V., Zlobin A.S., Shashkova T.I., Volkova N.A., Iolchiev B.S., Bagirov V.A., Borodin P.M., Karssen L.S., Tsepilov Y.A., Aulchenko Y.S. The GWAS-MAP|ovis platform for aggregation and analysis of genome-wide association study results in sheep. – 2022. – Preprint.

[5] 5. Bolormaa S., et al. A genome-wide association study of meat and carcass traits in sheep // Genetics Selection Evolution. – 2016. – Vol. 48. – P. 38.

[6] 6. Zhang L., Liu J., Zhao F., Ren H., Xu L., Lu J., Zhang S., Zhang X., Wei C., Lu G., Zheng Y., Du L. Genome-wide association studies for growth and meat production traits in sheep // PLOS ONE. – 2013. – Vol. 8(6). – e66569.

[7] 7. Riggio V., Pong-Wong R., Sallé G., et al. A genome-wide association study for wool, skin, and body weight traits in sheep // PLOS ONE. – 2013. – Vol. 8(12). – e81956.

[8] 8. Садыкулов Т. С., Адылканова Ш. Р. Селекционно-генетические аспекты совершенствования курдючных пород овец: монография. – Алматы: Альманах, 2022. – 180 с.

[9] 9. Jiang J., Cao Y., Shan H., Wu J., Song X., Jiang Y. The GWAS analysis of body size and population verification of related SNPs in Hu sheep // Animals. – 2022. – Vol. 12(20). -P. 2792. https://doi.org/10.3390/ani12202792

[10] 10. Abdoli R., Mirhoseini S.Z., Ghavi Hossein-Zadeh N., Zamani P., Ferdosi M.H., Gondro C. Genome-wide association study of four composite reproductive traits in Iranian fat-tailed sheep // Reproduction, Fertility and Development. – 2019. – Vol. 31(8). – P. 1305–1314. https://doi.org/10.1071/RD18282

[11] 11. Al-Mamun H.A., Kwan P., Clark S.A., Ferdosi M.H., Tellam R., Gondro C. Genome-wide association study of body weight in Australian Merino sheep reveals an orthologous region on OAR6 to human and bovine genomic regions affecting height and weight // Genetics Selection Evolution. – 2015. – Vol. 47. – P. 66.

[12] 12. Ghasemi M., Hossein-Zadeh N.G., Zamani P. Identification of candidate genes and pathways affecting meat quality traits in sheep using GWAS and bioinformatics analysis // Animal Genetics. – 2020. – Vol. 51. – P. 678–689

[13] 13. Kijas J.W., Lenstra J.A., Hayes B., Boitard S., et al. Genome-wide analysis of the world's sheep breeds reveals high levels of historic mixture and strong recent selection // PLOS Biology. – 2012. – Vol. 10(2). – e1001258.

[14] 14. Andersson L., Archibald A.L., Bottema C.D., et al. Coordinated international action to accelerate genome-to-phenome with FAANG, the Functional Annotation of Animal Genomes project // Genome Biology. – 2015. – Vol. 16. – P. 57.

[15] 15. Meuwissen, T. H. E., Hayes, B. J., & Goddard, M. E. (2013). Accelerating improvement of livestock with genomic selection. Annual Review of Animal Biosciences, 1, 221–237.

[16] 16. Садықұлов Т.С., Ким Г.Л., Жазылбеков Қ.З., Имашев С.Д., Бұралқиев Б.А. Ауыл шаруашылық жануарларын өсіру және селекциялау: оқу құралы. – Павлодар: Кереку, 2003. – 29–34-бб.

[17] 17. PLINK1.9Home. Available online: https://www.cog-genomics.org/plink/ (accessed on 14 April 2025)

[18] 18. Ensembl. Available online: http://www.ensembl.org/biomart/martview/ (accessed on 14 April 2025).

[19] 19. The R Project for Statistical Computing. Available online: https://www.r-project.org/ (accessed on 14 April 2024)