Войти в систему | Регистрация
Казахский национальный аграрный исследовательский университет ISSN 2304-3334 (Print)  ·  ISSN 2304-3334 (Online)
Подать статью
Меню
Подать статью
ЗЕМЛЕДЕЛИЕ, АГРОХИМИЯ, КОРМОПРОИЗВОДСТВО, АГРОЭКОЛОГИЯ

ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР

Лейла Надирова 1 , Гульшан Станбекова 2 , Руслан Крылдаков 2 , Булат Искаков 2

1 РГП на ПХВ Институт молекулярной биологии и биохимии им. М.А. Айтхожина; 2 Институт Молекулярной биологии и биохимии им. М.А.Айтхожина

doi.org/10.37884/3-2025/25 Стр. 269-276 Поступила 15.07.2025 Опубликовано 30.09.2025

Аннотация

Вироиды — это небольшие патогены растений, не кодирующие белки. Несмотря на простую структуру, вироиды могут вызывать серьёзные нарушения метаболизма и развития у растений, приводя к ряду симптомов, а также к снижению урожайности и качества продукции. Диагностика вироидов особенно актуальна для плодовых культур, поскольку инфекции часто протекают бессимптомно на ранних стадиях.

В работе представлены результаты одновременного выявления вироидов карликовости хмеля (HSVd) и латентной мозаики персика (PLMVd) в косточковых плодовых культурах. Тестированы образцы листьев персика, собранных на территории Наурызбайского района г. Алматы, проявившие клинические признаки вироидного заражения. Методом обратной транскрипции с последующей дуплексной полимеразной цепной реакцией (дуплекс ОТ-ПЦР) с использованием разработанных нами специфичных праймеров, в ряде образцов были выявлены РНК HSVd и PLMVd, а в одном образце было показано присутствие РНК обоих вироидов. В последующем была проведена очистка ампликонов, которые далее были секвенированы по Сэнгеру для определения нуклеотидных последовательностей обоих вироидов. BLAST-анализ показал выявление HSVd и PLMVd. Полученные данные указывают на циркуляцию HSVd и PLMVd в районе города Алматы. Это обосновывает необходимость внедрения регулярной диагностики вироидных инфекций косточковых плодовых культур в Казахстане.

вироиды косточковые культуры PLMVd HSVd дуплекс ОТ-ПЦР секвенирование нуклеотидный анализ

01 Введение

Полный текст статьи доступен для скачивания в формате PDF на панели справа.

02 Список литературы

  1. 1 Flores, R., Hernández, C., Martínez de Alba, A. E., Daròs, J. A., & Di Serio, F. (2005). Viroids and viroid-host interactions. Annual review of phytopathology, 43, 117–139. https://doi.org/10.1146/annurev.phyto.43.040204.140243.
  2. 2 Ortolá, B., & Daròs, J. A. (2023). Viroids: Non-Coding Circular RNAs Able to Autonomously Replicate and Infect Higher Plants. Biology, 12(2), 172. https://doi.org/10.3390/biology12020172.
  3. 3 Zhang, Y., Bisaro, D. M., & Wu, J. (2025). Recent advances in viroid research. Virology, 604, 110424. https://doi.org/10.1016/j.virol.2025.110424.
  4. 4 Marquez-Molins, J., Gomez, G., & Pallas, V. (2021). Hop stunt viroid: A polyphagous pathogenic RNA that has shed light on viroid-host interactions. Molecular plant pathology, 22(2), 153–162. https://doi.org/10.1111/mpp.13022.
  5. 5 Sano T. (2021). Progress in 50 years of viroid research-Molecular structure, pathogenicity, and host adaptation. Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences, 97(7), 371–401. https://doi.org/10.2183/pjab.97.020.
  6. 6 Di Serio, F., Owens, R. A., Li, S. F., Matoušek, J., Pallás, V., Randles, J. W., Sano, T., Verhoeven, J. T. J., Vidalakis, G., Flores, R., & Ictv Report Consortium (2021). ICTV Virus Taxonomy Profile: Pospiviroidae. The Journal of general virology, 102(2), 001543. https://doi.org/10.1099/jgv.0.001543.
  7. 7 Hadidi, A., Sun, L., & Randles, J. W. (2022). Modes of Viroid Transmission. Cells, 11(4), 719. https://doi.org/10.3390/cells11040719.
  8. 8 Kaponi, M., Kyriakopoulou, P. E., & Hadidi, A. (2024). Viroids of the Mediterranean Basin. Viruses, 16(4), 612. https://doi.org/10.3390/v16040612.
  9. 9 Serra, P., Barbosa, C. J., Daròs, J. A., Flores, R., & Duran-Vila, N. (2008). Citrus viroid V: molecular characterization and synergistic interactions with other members of the genus Apscaviroid. Virology, 370(1), 102–112. https://doi.org/10.1016/j.virol.2007.07.033.
  10. 10 Vernière, C., Perrier, X., Dubois, C., Dubois, A., Botella, L., Chabrier, C., Bové, J. M., & Vila, N. D. (2006). Interactions between citrus viroids affect symptom expression and field performance of clementine trees grafted on trifoliate orange. Phytopathology, 96(4), 356–368. https://doi.org/10.1094/PHYTO-96-0356.
  11. 11 Nadirova L.T., Stanbekova G.E., Iskakov B.K., ZHigajlov A.V. (2024). Diagnostika of Peach latent mosaic viroida latentnoj mozaiki persika (PLMVd) metodom OT-PCR. Izdenister natigeler - Issledovaniya, rezul'taty. 103(3). 114–123. https://doi.org/10.37884/3-2024/13 [in Russian].
  12. 12 Stanbekova, G.E.; Nadirova, L.T.; Kryldakov, R.V.; Iskakov, B.K.; Zhigailov, A.V. (2025) First Detection and Molecular Characterization of Peach Latent Mosaic Viroid (PLMVd) in Kazakhstan. Pathogens, 14, 243. https://doi.org/10.3390/pathogens14030243.
  13. 13 Marquez-Molins, J., Gomez, G., & Pallas, V. (2021). Hop stunt viroid: A polyphagous pathogenic RNA that has shed light on viroid-host interactions. Molecular plant pathology, 22(2), 153–162. https://doi.org/10.1111/mpp.13022.
  14. 14 Pecman, A., Kutnjak, D., Gutiérrez-Aguirre, I., Adams, I., Fox, A., Boonham, N., & Ravnikar, M. (2017). Next Generation Sequencing for Detection and Discovery of Plant Viruses and Viroids: Comparison of Two Approaches. Frontiers in microbiology, 8, 1998. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.01998.
  15. 15 Li, R., Mock, R., Huang, Q., Abad, J., Hartung, J., & Kinard, G. (2008). A reliable and inexpensive method of nucleic acid extraction for the PCR-based detection of diverse plant pathogens. Journal of virological methods, 154(1-2), 48–55. https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2008.09.008.
  16. 16 Hassan, M., Rysanek, P., & Di Serio, F. (2003). First Report of Peach Latent Mosaic Viroid and Hop Stunt Viroid Infecting Peach Trees in the Czech Republic. Plant Disease, 87(12), 1537. https://doi.org/10.1094/PDIS.2003.87.12.1537B
  17. 17 Fekih Hassen, I., Kummert, J., Marbot, S., Fakhfakh, H., Marrakchi, M., & Jijakli, M. H. (2004). First Report of Pear Blister Canker Viroid, Peach Latent Mosaic Viroid and Hop Stunt Viroid Infecting Fruit Trees in Tunisia. Plant Disease, 88 (10), 1164. https://doi.org/10.1094/PDIS.2004.88.10.1164A
  18. 18 Lin, C.-Y., Wu, M.-L., Shen, T.-L., & Hung, T.-H. (2015). A mutual titer-enhancing relationship and similar localization patterns between Citrus exocortis viroid and Hop stunt viroid co-infecting two citrus cultivars. Virology Journal, 12, Article 142. https://doi.org/10.1186/s12985-015-0357-6

Ссылки для цитирования

[1]2025. ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР . Izdenister natigeler. 3 (107) (Sep. 2025), 269–276. DOI:https://doi.org/10.37884/3-2025/25.
(1)ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР . Izdenister natigeler 2025, No. 3 (107), 269-276. https://doi.org/10.37884/3-2025/25.
ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР . (2025). Izdenister Natigeler, 3 (107), 269-276. https://doi.org/10.37884/3-2025/25
ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР . Izdenister natigeler, [S. l.], n. 3 (107), p. 269–276, 2025. DOI: 10.37884/3-2025/25. Disponível em: https://natsus.kaznaru.edu.kz/index.php/research/article/view/1031. Acesso em: 15 sep. 2026.
“ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР ”. 2025. Izdenister Natigeler, no. 3 (107) (September): 269-76. https://doi.org/10.37884/3-2025/25.
“ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР ” (2025) Izdenister natigeler, (3 (107), pp. 269–276. doi:10.37884/3-2025/25.
[1]“ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР ”, Izdenister natigeler, no. 3 (107), pp. 269–276, Sep. 2025, doi: 10.37884/3-2025/25.
“ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР ”. Izdenister Natigeler, no. 3 (107), Sept. 2025, pp. 269-76, https://doi.org/10.37884/3-2025/25.
“ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР ”. Izdenister natigeler, no. 3 (107) (September 30, 2025): 269–276. Accessed September 15, 2026. https://natsus.kaznaru.edu.kz/index.php/research/article/view/1031.
1.ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР . Izdenister natigeler [Internet]. 2025 Sep. 30 [cited 2026 Sep. 15];(3 (107):269-76. Available from: https://natsus.kaznaru.edu.kz/index.php/research/article/view/1031
1.ДИАГНОСТИКА ВИРОИДОВ КАРЛИКОВОСТИ ХМЕЛЯ (HSVd) И ЛАТЕНТНОЙ МОЗАИКИ ПЕРСИКА (PLMVd) КОСТОЧКОВЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ДУПЛЕКСНОЙ ОТ-ПЦР . Izdenister natigeler. 2025;(3 (107):269-276. doi:10.37884/3-2025/25